微生态研究
研究正常微生物群的结构、功能及其与宿主相互依赖和相互制约关系的科学
项目介绍
元基因组学（Metagenomics），也称宏基因组学，研究以环境中所有微生物基因组为研究对象，通过对环境样品中的全基因组DNA进行高通量测序，获得单个样品的总的基因序列，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。在人体微生态领域，元基因组技术的出现，更加清楚地揭示了微生物与人体之间的微妙关系，成功绕开了“不可培养微生物”对人体微生物深入研究的阻碍，为开发利用“不可培养微生物”基因组提供了坚实的技术支撑。目前，在人体微生物活性物质的开发与利用、微生物分布及功能动态变化分析、疾病和人体微生物的因果关系等方面有广泛应用。
生信分析
慕柏优势
~~~从实验设计到生信分析的一站式服务~~~
研究内容多样：通过对群落中所有微生物进行全基因组分析，研究群落的物种、基因、功能结构/差异，并可以和代谢组学等进行关联分析，深入研究微生物的作用机制。
可组装单菌：对于简单的环境，可以获得较好的单菌基因组，并进行深入的功能挖掘。
个性化分析：提供针对人体微生物的个性化分析/高级分析内容，其他个性化分析需求可与信息分析同事沟通。
结果展示
eggNOG分析：
eggNOG (evolutionary genealogy of genes: Non-supervised Orthologous Groups，http://eggnog.embl.de/)数据库: 是国际上普遍认可的同源聚类基因群的专业注释数据库，使用BLASTP（BLAST Version 2.2.28+，http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）将基因集序列与eggNOG数据库进行比对（BLAST比对参数设置期望值e-value为1e-5），获得基因对应的COG （Clusters of orthologous groups of proteins，直系同源序列聚类），然后使用COG对应的基因丰度总和计算该COG的丰度。
NetWork 网络图分析：
生态学中一般认为功能上关系密切的群落往往表现出丰度的“同升同降”，根据微生物群落丰度信息计算样本中物种之间的相关性，并据此划分不同的共变化组（Co-abundance group，CAG）；可发现物种间的相互关系、CAG与生理指标或环境因子间的关系。
物种网络图中节点代表存在相互关系的物种，图中一个节点代表一个OTU，节点的大小代表了在样本中丰度的多少。同种颜色的节点代表一个CAG。节点间的连线的粗细代表OTU之间的相关性大小，线条越粗，相关性越大，图中只画出了相关性系数大于0.5的连线；红色线条表示正相关，灰色线条表示负相关。OTU共表达网络分析网络图的展示形式多变，一般显示样本间及物种间的关系，计算CAG时样本数须大于18个。
